Мир оказался под угрозой нового штамма коронавируса

Новых разновидностей коронавируса, которые бы называли греческими буквами, не появлялось со времени «Омикрона». А все потому, что все последние варианты SARS-CoV-2 были так или иначе производными от уже известных штаммов или их союзов.

Однако недавно возникший одновременно в разных уголках земного шара вариант, пока условно именуемый ВА.2.86 («Пирола») и уже включенный в список ВОЗ как “находящийся под наблюдением”, имеет неплохие шансы стать вариантом «Пи». Причина — не только в большом количестве мутаций, но и в эволюционном скачке, который, по данным вирусологов, сравним с тем, в результате которого родилась линия «Омикрон».

Куда эволюционирует коронавирус и чего нам ждать дальше, «МК» узнал у экспертов.

Итак, как сообщают ученые, по данным на прошлой неделе были обнаружены геномы нового варианта SARS-CoV-2: в Дании, в Израиле и в Мичигане (США). Очередной геном сверхмутировавшего варианта на днях был выявлен в Лондоне. А вчера стало известно, что география штамма BA.2.86 (“Пирола”) снова расширилась. Как рассказывает известный американский генетик Дмитрий Прус, появились образцы месячной давности из южноафриканских провинций Гаутенг и Мпумаланга:  “Именно на их стыке располагался тот самый никогда не идентифицированный очаг штаммогенеза (генерирования новых штаммов. – Авт.), давший нам все основные предыдущие «Омикроны». Швейцарцы видели его в сточных водах в одном из 20 их водоочистных районов на уровне около 2%. Но новых образцов пациентов пока нет”.

Научное сообщество с тревогой воспринимает появление нового варианта вируса. «Такой широкий географический разброс позволяет предположить, что новый вариант не затухнет и проявит себя в ближайшем будущем. ВА.2.86 имеет более 30 новых мутаций в белке шипа», – рассказывает врач лабораторной диагностики Александр Соловьев.

По его словам, официально новому варианту пока не присвоена буква греческого алфавита: для этого требуется, чтобы ВА.2.86 попал в категорию “вызывающий опасение”. Однако ближайшие недели и месяцы прояснят ситуацию с этим новым вариантом вируса.

На данный момент известно про BA.2.86 немного, и его контагиозность (заразность) оценить сложно. Неясно также, насколько тяжелое течение болезни он способен вызывать, и как его появление повлияет на летальность от ковида. Неизвестна и его способность убегать от иммунитета, в том числе вакцинного. Нет доказательств того, что BA.2.86 распространяется быстрее или вызывает более серьезные заболевания, чем предыдущие версии.

«Выявлен второй американский случай BA.2.86 (“Пирола”), впервые обнаруженного на прошлой неделе по всему свету гипермутанта, про который продолжают подозревать, что это будущий “Пи” (или “Ро” – кто знает, перейдет ли ВОЗ от греческой буквы «Омикрон» к следующей или пропустит букву, как они это сделали в прошлый раз), – рассказывает Дмитрий Прус. – Новый геном – это новая ветвь эволюционного древа «Пиролы». И география новая: хотя его выявили в Америке, но пациентка прилетела из Японии в вашингтонский аэропорт, и была протестирована по прибытии. Так что к географии вируса можно добавить Восточную Азию (предыдущие образцы – первый из Израиля, три из Дании, один из Англии и один из Мичигана)».

Генетик успокаивает, что, несмотря на широкую географию, которая не оставляет сомнений в способности вируса распространяться, уже сейчас можно исключить самые ужасные предположения об инфекционности или патогенности вируса: «В Израиле и Дании прошел уже месяц в присутствии нового штамма, а крутой волны не наблюдается, и в самых свежих загрузках из обоих стран ни одного BA.2.86 не обнаружено. Не нашли новых BA.2.86 и в Англии в почти 300 новых геномах. В Америке только за понедельник было также загружено более полутора тысяч августовских геномов, но нет ни следа «Пиролы». И в Австрии, известной быстрым и качественным анализом мутаций, в сточных водах ничего не нашли. Таким образом, уровни нового штамма или не растут исключительно быстро, или пока настолько исключительно редки, что оценить их скорость роста еще невозможно. С патогенностью тоже данных очень мало, но ничего исключительно опасного пока не видно. Да, в Лондоне престарелый пациент был госпитализирован (и только благодаря этому попал в экспресс-секвенирование), но в Мичигане такой же престарелый пациент был с легкими симптомами, в Дании тоже ни у кого не было необычно тяжелых симптомов, а новая пациентка-путешественница из Японии – бессимптомная. По такому скудному набору данных много не скажешь, но на супер-патоген эта картина не похожа. Ждем дополнительных наблюдений, и ждем обещанных из Дании исследований иммунных свойств уже выделенного ими вируса».

Что происходит с коронавирусом сегодня? Можно ли уже говорить об определенных тенденциях, по которым он эволюционирует, или все изменения пока непредсказуемые? На вопросы обозревателя «МК» ответила микробиолог, ассистент кафедры науки педагогического факультета Manchester Metropolitan University Виктория Доронина

– Вирусы зависят от живых организмов, которые они инфицируют, это важно для их размножения. Смерть организма-хозяина до того, как он успел передать вирус, с эволюционной точки зрения невыгодна, поскольку она ограничивает размножение вируса, является тупиком. Поэтому в общем случае вирус эволюционирует в сторону уменьшения летальности. Кроме того, варианты вируса конкурируют между собой, и выигрывает тот, который распространяется быстрее. Летальность и скорость распространения – качества не абсолютно связанные с друг другом, но коррелирующие.

Про “старших братьев” COVID-19 – штаммы SARS и MERS — слышали далеко не все, потому что при более высокой летальности они плохо передавались от человека к человеку. В результате их удалось быстро остановить. Но COVID-19, который был менее летален, но распространялся гораздо быстрее, прошёл по пути дальнейшего увеличения скорости распространения и ослабления летальности, но не без отклонений. 

Первый широко распространившийся вариант “Aльфа”, который отличался от уханьского вируса “дикого типа”, размножался быстрее без снижения летальности. То же самое случилось с несколькими последующими вариантами. Однако в конце концов отобрались варианты, которые распространяются быстро, но вызывают менее серьёзное заболевание.

Мне кажется маловероятным появление варианта, который не только полностью сможет избежать уже накопившийся коллективный иммунитет, но при этом будет очень летальным. Более вероятно, что на фоне общего снижения иммунитета к другим респираторным вирусам начнет наращивать силы «старый» враг — грипп, или это сделает другой респираторный вирус, которых циркулирует более 80 видов.

– Сейчас в лентах новостей чаще всего говорят о вариантах «Эрис» («Эрида») и новом ВА.2.86. В чем их потенциальная опасность?

– «Эрис» (EG.5) – это потомок «Омикрона», который впервые был зарегистрирован в феврале 2023. «Эрис» распространяется быстрее, чем другие штаммы: например, в Британии, в которой определяют много генетических последовательностей ковида, он составляет 1 из 7 случаев заболевания. Однако его распространение не привело к массовому всплеску госпитализаций, а значит, он не более летален, чем предыдущие варианты.

У варианта  BA.2.86 есть более 30 мутаций в белке, который отвечает за проникновение вируса в клетку, то есть, он сильно отличается от других вариантов. Он зарегистрирован в нескольких регионах (Израиль, США, Дания, Британия) и быстро распространяется. Однако неясно, насколько сильное заболевание он вызывает, поскольку пока слишком мало людей, которые им заболели. Однако среди учёных и врачей есть консенсус, что на фоне сформировавшегося коллективного иммунитета маловероятно, что он вызовет сильное увеличение числа тяжёлых заболеваний и смертности. Почему об этих штаммах пишут? Почему ВОЗ присвоила «Эриде» буквенное обозначение, как «Альфе», «Дельте», «Омикрону»? Потому что неизвестно, из которого из этих «гадких утят» может вырасти чёрный лебедь, за ними нужно наблюдать.

– Пандемия действительно кончилась или может вернуться в любой момент?

– В 2019 году человеческое сообщество оказалось как будто в сухом деревянном доме, в который летели огненные стрелы ковида – каждое попадание вызывало возгорание, которое грозило сжечь дом дотла. Сейчас дом частично залит пожарной пеной, а где-то водой, которую бросали на пламя хозяева дома. Даже если происходит возгорание, огонь натыкается на мокрую часть и не может распространиться. Пандемия COVID-19 закончилась, поскольку с помощью прививок и переболевших сформировался коллективный иммунитет, который ослабляет или останавливает распространение вируса. Люди, которые могут формировать иммунитет, привились или переболели. Но это не предохраняет нас от пандемии любого другого вируса, который значительно отличается от COVID-19.

– Недавно канадские ученые сообщили о том, что резервуарами для мутаций могут стать белохвостые олени. Каких ещё животных может выбрать коронавирус для мутаций?

– COVID-19 с начала пандемии показал способность заражать не только человека, но и широкий спектр млекопитающих. Что неудивительно, поскольку резервуаром ковида являются летучие мыши – далеко отстоящее в эволюционном плане от приматов семейство млекопитающих. Например, вирус начали находить у кошек и собак, которых заразили хозяева. В ноябре 2020 в Дании были уничтожены все норки, которых разводили для получения меха, поскольку не только COVID-19 передался от людей к норкам, как в случае кошек и собак, но было зарегистрировано несколько десятков случаев обратной передачи от норок к людям.

Поэтому история с белохвостыми оленями не уникальна. Было понятно, что вирус продолжит циркулировать в человеческой популяции, а поскольку он может заражать других млекопитающих, значит, появление резервуаров тоже вероятно. Белохвостые ли это олени, лисы или мыши не очень важно, олени даже лучше, поскольку средний человек в городе взаимодействует с ними гораздо реже, чем с лисами или, тем более мышами.

– Есть ли какие-то способы предсказывать вспышки коронавируса с учетом отсутствия сезонности – может, математическое моделирование?

– Математическое моделирование используется для предсказания не только пандемии коронавируса, но и других вирусов, например, вируса гриппа. Но можно сказать, что именно пандемия COVID-19 вывела его на качественно новый уровень. Например, в Британии именно моделирование учеными из Имперского Колледжа, которое показало, что при отсутствии значительных усилий по остановке распространения вируса, система здравоохранения развалится и смертность достигнет полмиллиона человек, привело к установлению жёстких карантинов.

Однако моделирование само себе – рычаг без точки опоры. Мoжно моделировать что угодно, но если правительство и население не верят моделям, да и в целом учёным, они бесполезны.

– Недавний опрос показал, что три четверти российских врачей выступают против обязательной вакцинации от коронавируса – насколько это сейчас разумно, необходимо?

– В отличие от многих цивилизованных стран, Россия не смогла убедить большинство населения в необходимости вакцинации, когда вирус был более страшен. В нынешних условиях коллективного иммунитета и ослабления смертности нет необходимости принуждать людей прививаться.

В Британии прививки для групп риска – люди старше 50, с хроническими заболеваниями сердечно-сосудистой системы, диабетом I типа и т.п. – бесплатны, но добровольны.

– Могут ли в ближайшее время появиться вакцины, универсальные для любых вариантов?

– Мишенью коронавирусных вакцин является белок, который используется для проникновения вируса в клетку. Он же – мишень иммунных клеток организма, поэтому отбираются варианты, которые могут избегать иммунного ответа – помните «Эриду» с ее 30 новыми мутациями? Теоретически, можно создать вакцину к менее изменчивым частям вируса, которые одинаковые у всех штаммов, а потому она будет защищать от всех вариантов. Эти части потому и малоизменчивы, что не вызывают иммунного ответа. Они сложены так, что скрыты от клеток иммунной системы, к ним не образуются антитела. Универсальную вакцину против гриппа пытаются создать несколько десятков лет, вроде как есть подающие надежду разработки, но пока только разработки. Возможно, учитывая новые  технологии, которые применяются при производстве вакцин против COVID-19, создание универсальной вакцины против него займёт меньше времени, но пока об этом мне ничего неизвестно.